Postupak reakreditacije podrazumijeva postupak provjere minimalnih uvjeta propisanih zakonom kao i vanjsko neovisno vrednovanje kvalitete doktorskih programa prema kriterijima za ocjenu kvalitete. Svrha samoanalize je pokazati ispunjenost propisanih uvjeta doktorskog programa te što uspješnije predstaviti (visoku) kvalitetu doktorskih programa. Visoko učilište, najčešće kroz svoje ustrojbene jedinice i voditelja/icu doktorskog programa, izrađuje samoanalizu prema sljedećim uputama:

1. 1. Samoanaliza se izrađuje za svaki doktorski program na hrvatskom i engleskom jeziku.
   2. Samoanaliza se izrađuje prema kriterijima za ocjenu kvalitete, odnosno uputama i preporukama dokumenta Načela i kriteriji poslijediplomskih sveučilišnih studija (VU se pri izradi može koristiti Obrascem(HRV)/Draft form(ENG) Agencije te ga prilagoditi prema vlastitim potrebama).
   3. Obavezan dio samoanalize su tablice 1. i 2., uzorak sinopsisa, disertacija i individualnih planova rada doktoranada te strateški program znanstvenih istraživanja. VU može Agenciji priložiti i druge dokumente i dokaze (pravilnike/dokumente internog osiguravanja kvalitete).
   4. Samoanaliza može biti do 50 str.
   5. VU treba, ako već nije, obnoviti podatke u sustavu MOZVAG i mrežne stranice na kojima su dostupne bibliografske informacije znanstvenika (vlastite ili CROSBI) prije predaje samoanalize.