Za potrebe drugog petogodišnjeg ciklusa reakreditacije koji će započeti 2016. godine, Agencija za znanost i visoko obrazovanje priprema novi koncept vrednovanja visokih učilišta s naglaskom na vrednovanju ishoda učenja i provedbi Hrvatskog kvalifikacijskog okvira (HKO). Prema HKO-u, svaka kvalifikacija stečena u Hrvatskoj ima svoje mjesto. U središtu su ishodi učenja, odnosno kompetencije koje je osoba stekla učenjem i dokazala nakon postupka učenja. Svakoj kvalifikaciji stečenoj u Hrvatskoj mjesto je određeno prema razini koju imaju skupovi ishoda učenja koji pripadaju toj kvalifikaciji.

U skladu s time, drugi ciklus reakreditacije bit će usmjeren na procjenu kvalitete studijskih programa, odnosno procjeni jesu li uvjeti izvođenja studijskog programa takvi da omogućuju stjecanje predviđene kvalifikacije. U užem smislu, to podrazumijeva usklađenost ishoda učenja studijskog programa s odgovarajućom razinom HKO-a, profilom studija (sveučilišni ili stručni) i zahtjevima struke, prikladnost metoda poučavanja za stjecanje ishoda učenja, relevantnost i objektivnost ocjenjivanja studenata te pružanje odgovarajuće potpore u učenju. U širem smislu, novi ciklus vrednovanja odrazit će se i na razinu istraživačke djelatnosti visokog učilišta, mobilnost studenata i nastavnika te internacionalizaciju visokih učilišta, odnosno studijskih programa. U planiranje i razvoj novoga reakreditacijskog ciklusa, Agencija će svakako uključiti i akademsku zajednicu.